巴蜀學校創辦于1933年，創建人乃原國民政府四川省主席王纘緒，它坐落于嘉陵江畔的張家花園，原是一所集幼稚園、小學、初中和高中于一體的聞名遐邇的私立學校。創建初期江蘇教育家周勖成由黃炎培親薦出任首任校長，盧作孚、康心如、何魯等任校董，定下了“公正誠樸”校訓,其意為：公而忘私，正大光明，誠實毋欺，樸實無華。1950年新中國解放后，由西南軍政委員會接管，成為西南局干部子弟學校，鄧小平同志親口指示“一切不變，只許辦好，不許辦壞”。1954年西南大區撤銷，學校交重慶教育局直管，1955年8月，巴蜀學校一分為三，中學部改為重慶市第41中學校。1991年更名為重慶市巴蜀中學校。

新世紀的巴蜀中學，學校有一個目光遠大、思想先進、銳意改革、開拓創新的領導班子。1998年由時任校長傅唯泉創造性提出了核心辦學理念：教育以人為本，校長以教師為本，教師以學生為本。他認為，實施素質教育的著眼點和歸宿點都必須是“人”，必須是發現、挖掘學生潛能，注重學生人格塑造和情商開發，張揚人的個性的教育?！耙匀藶楸尽辈粏问菍W校教育的根本，也是社會教育、家庭教育的根本。在此基礎上，2010年，學校新任領導班子又深化提出了培養“善雅志”社會英才的德育理念——善為根，雅為骨，志為魂。善為根。善養于心，孝慈誠讓；上善若水，厚德濟生。善，乃立人之根本。雅為骨。雅修于情，高潔慧美；雅潤如玉，君子淑女。雅，乃處世之風骨。志為魂。志立于行，堅韌精進；志比鴻鵠，胸懷天下。志，乃成才之魂魄。張揚個性，挖掘潛能，是巴蜀中學的辦學特色。培養具有民族自尊心、民族自豪感的龍的傳人，培養具有健康身心、健全人格的文明的人，培養勇于創新、善于學習的智慧的人，培養具有國際視野的開放的人，培養腳踏實地、勤奮實干的務實的人，這是我校的培養目標。

目前學校格局為一校四區：黃花園本部校區、魯能巴蜀中學校區、金科巴蜀中學校區，龍湖巴蜀學校校區，總占地340畝，總建筑面積255601平方米，是全國中學辦學規模最大的中學之一。

巴蜀中學是重慶市教委直屬重點中學，北京大學首批校長實名推薦制中學，清華大學首批自主選拔“新百年領軍計劃”推薦資格中學，連續四屆入選中國百強中學，2011年入選美國馬里蘭大學評選的中國高中五十強（第23名），全國現代教育技術實驗學校，漢語國際推廣中小學基地，全國國際象棋高水平后備人才培訓基地，CCTV“最佳雇主”，中央人民廣播電臺“全國最具幸福感的學?！焙汀叭珖@文化特色獎”,全國德育先進學校，全國藝術教育先進學校，全國奧林匹克教育示范學校，重慶市文明單位，影響重慶教育十大品牌中學，重慶市教育科研實驗基地，重慶市民主管理示范學校。